自動核酸蛋白層析儀采用琴式結構一體化設計，大大縮小了儀器的體積，減小儀器在實驗室的占用面積，使整套儀器配置性能、可靠性得到很大的提高，并解決了在調試過程中繁瑣的連接問題，提高了工作效率。
自動核酸蛋白層析儀的基本原理是在毛細管內用高電壓進行物質分離，具有分析速度快、重現性好、效率高樣品使用量少等優點，已經廣泛的被應用于小離子、小分子、多肽及蛋白質等物質的分離分析研究中。
然而現有的核酸蛋白質分析系統一般采用全人工或者半人工的操作，智能化水平比較低，并由于人為原因可能對實驗測試結果產生干擾，影響實驗的正確性。
自動核酸蛋白層析儀的操作步驟：
1.按要求連接儀器（檢測儀、收集器、恒流泵、電腦）。
2.打開電源開關，儀器自動復位，儀器預熱20分鐘。自動收集器準備狀態下可按“預置”鍵，進入相應的“定時”或“定滴”等狀態。調整層析參數，數據設定后，按“預置”鍵使數碼管全為“日”，按“定時”或“定滴”鍵指示燈亮，即進入定時收集狀態。
3.恒流泵流量視層析柱大小選擇合適流量。
4.剃度混合儀兩杯之間通道內如果存有氣泡，應設法除去方能使用；打開輸出閥門，根據需要的斜率，緩慢調節輸出流量。
5.檢查檢測儀波長是否正確，把“靈敏度”選擇為“T”，調“T”為100把“靈敏度”選擇為“1A”，（1A為常用檔，視樣品出峰大小也可選其它檔），調節“調零”旋鈕，使“A”為零調整通光率T，轉換成吸光度A，與電腦建立連接。通過核酸蛋白檢測軟件，設定參數，記錄分離結果并分析。
